MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella woodyi ATCC 51908 chromosome

Total Repeats: 17376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010506	TAAGG	2	10	2	11	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010506	A	6	6	14	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010506	CAA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010506	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010506	GCC	2	6	193	198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010506	GATC	2	8	206	213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010506	TAA	2	6	223	228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010506	T	6	6	244	249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010506	AGG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010506	ATCT	2	8	304	311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010506	TTA	2	6	322	327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010506	CTTT	2	8	365	372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010506	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010506	T	7	7	2963	2969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010506	TGA	2	6	3004	3009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010506	TCT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010506	CTTT	2	8	3079	3086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010506	AGA	2	6	6698	6703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010506	T	6	6	6724	6729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010506	AGG	2	6	6820	6825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010506	GTA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010506	TGTA	2	8	7018	7025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010506	GCA	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010506	TTG	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010506	ATA	2	6	9157	9162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010506	A	6	6	11918	11923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010506	TTA	2	6	12697	12702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010506	AT	3	6	14425	14430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010506	A	7	7	14494	14500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010506	TA	3	6	17645	17650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010506	TCG	2	6	18550	18555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010506	CTA	2	6	18562	18567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010506	AACC	2	8	18586	18593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010506	A	6	6	18638	18643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010506	GAA	2	6	18662	18667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010506	T	6	6	18686	18691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010506	TCA	2	6	18695	18700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010506	TTA	2	6	18716	18721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010506	T	6	6	19462	19467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010506	CTTT	2	8	19499	19506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010506	TAAA	2	8	19528	19535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010506	ATT	2	6	19618	19623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010506	T	6	6	19622	19627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010506	A	6	6	19641	19646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010506	TTA	3	9	22934	22942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010506	CTTT	2	8	22957	22964	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010506	ACCTG	2	10	23014	23023	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010506	TTAT	2	8	23088	23095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010506	AAAACA	2	12	23116	23127	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010506	GTA	2	6	23130	23135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010506	AATG	2	8	23144	23151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010506	TTGAG	2	10	23152	23161	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010506	A	6	6	23177	23182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010506	GGAT	2	8	23183	23190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010506	TGA	2	6	23207	23212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010506	AAC	2	6	23725	23730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010506	TGA	2	6	25139	25144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010506	TAAA	2	8	25155	25162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010506	TTCC	2	8	26405	26412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010506	TGT	2	6	28605	28610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010506	TCA	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010506	CGA	2	6	28687	28692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010506	AAAT	2	8	28697	28704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010506	ACA	2	6	28706	28711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010506	TTG	2	6	28734	28739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010506	TGG	2	6	28743	28748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010506	AGAATT	2	12	28807	28818	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010506	AAT	2	6	28819	28824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010506	ACT	2	6	32340	32345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010506	A	6	6	32904	32909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010506	TGT	2	6	32929	32934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010506	ACTC	2	8	33273	33280	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010506	GTT	2	6	33305	33310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010506	TTC	2	6	33405	33410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010506	AGCA	2	8	33429	33436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010506	TGA	2	6	35387	35392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010506	TAA	2	6	35429	35434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010506	TGGC	2	8	35435	35442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010506	T	6	6	35449	35454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010506	ACA	2	6	35776	35781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010506	CAAGG	2	10	35816	35825	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010506	TAA	2	6	36267	36272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010506	A	6	6	36281	36286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010506	TGT	2	6	36290	36295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010506	GTT	2	6	36300	36305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010506	ATT	2	6	36334	36339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010506	GGA	2	6	36357	36362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010506	TGGC	2	8	36687	36694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010506	TC	3	6	36751	36756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010506	GAA	2	6	36763	36768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010506	GAT	2	6	36776	36781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010506	A	6	6	36783	36788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010506	AAT	2	6	36793	36798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010506	GCT	2	6	38926	38931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010506	TA	4	8	43225	43232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010506	TA	3	6	43255	43260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010506	GTT	2	6	44458	44463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010506	CTA	2	6	44503	44508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010506	AAAG	2	8	46031	46038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010506	CCT	2	6	46049	46054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010506	T	6	6	46054	46059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010506	CA	3	6	46126	46131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010506	AAG	2	6	46151	46156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010506	C	6	6	46188	46193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_010506	CAT	2	6	48663	48668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010506	ATT	2	6	48706	48711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010506	ATA	2	6	49285	49290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010506	A	6	6	49294	49299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010506	CATAGA	2	12	50247	50258	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010506	TG	3	6	50295	50300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010506	AGTC	2	8	50870	50877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010506	AGA	2	6	50919	50924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010506	GT	4	8	52623	52630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010506	CTC	2	6	52642	52647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010506	TAA	2	6	52767	52772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010506	CAG	2	6	52827	52832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010506	TAGA	2	8	52855	52862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010506	GCA	2	6	52872	52877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010506	GTTT	2	8	52975	52982	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010506	CTG	2	6	53004	53009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010506	ATC	2	6	53018	53023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010506	CTT	2	6	53034	53039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010506	CCT	2	6	53082	53087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010506	CA	3	6	53114	53119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010506	TG	3	6	53158	53163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010506	TTC	2	6	53315	53320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010506	A	7	7	53341	53347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010506	GGC	2	6	53388	53393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010506	GCG	2	6	53454	53459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010506	AGG	2	6	53549	53554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010506	TAG	2	6	53601	53606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010506	CGA	2	6	53629	53634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010506	GAT	2	6	53654	53659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010506	GCA	2	6	53703	53708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010506	GT	3	6	53756	53761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010506	GAA	2	6	53762	53767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010506	GAG	2	6	53796	53801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010506	TAA	2	6	53816	53821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010506	AGA	2	6	53845	53850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010506	CAG	2	6	53871	53876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010506	G	6	6	54018	54023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010506	GGC	2	6	54082	54087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010506	GAA	2	6	54325	54330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010506	TGC	2	6	54401	54406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010506	GTC	2	6	54413	54418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010506	CCTTAT	2	12	54465	54476	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010506	GGA	2	6	54527	54532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010506	GAC	2	6	54540	54545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010506	TCA	2	6	54552	54557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010506	AC	3	6	54578	54583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_010506	AC	3	6	54747	54752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010506	CCT	2	6	54888	54893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_010506	CA	3	6	54929	54934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_010506	CTTGTT	2	12	54940	54951	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_010506	AAAT	2	8	55034	55041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010506	GTTT	2	8	55173	55180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010506	GTA	2	6	55264	55269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010506	TAAG	2	8	55344	55351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010506	GGA	2	6	55415	55420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010506	TAG	2	6	55444	55449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_010506	AACT	2	8	55545	55552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_010506	G	6	6	55601	55606	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010506	TCC	2	6	55611	55616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_010506	CTGA	2	8	55631	55638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_010506	GGA	2	6	55921	55926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010506	TAC	2	6	56125	56130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_010506	AC	3	6	56138	56143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_010506	CGTC	2	8	56156	56163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_010506	AAC	2	6	56175	56180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_010506	AGC	2	6	56265	56270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_010506	CAT	2	6	56271	56276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_010506	AAAG	2	8	56279	56286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010506	AGTCG	2	10	56301	56310	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_010506	TGAAGG	2	12	56406	56417	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_010506	AGGCT	2	10	56630	56639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
179	NC_010506	GCG	2	6	56643	56648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_010506	AGT	2	6	56743	56748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010506	TCT	2	6	56771	56776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_010506	GA	3	6	56847	56852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010506	TGA	2	6	56916	56921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010506	CT	3	6	56928	56933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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194	NC_010506	GGT	2	6	57593	57598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
195	NC_010506	CGG	2	6	57680	57685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_010506	GATAG	2	10	77620	77629	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_010506	A	6	6	78052	78057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010506	TTC	2	6	78065	78070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_010506	GTT	2	6	119872	119877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
437	NC_010506	ATTTA	2	10	121501	121510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_010506	TTA	2	6	121574	121579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_010506	A	7	7	121612	121618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_010506	TCT	2	6	121670	121675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_010506	TAA	2	6	125801	125806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_010506	AGA	2	6	126067	126072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_010506	CAA	2	6	128898	128903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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